第二天在告别了悟松先生后孤叶与洁儿跟着小智一行来到了下个道馆所在地——百代市！
可是一到百代道馆一问道馆馆主竟然跑出去还没回来所以众人只能来到了百代历史博物馆消磨时间了！
可是一切都不平静孤叶与洁儿在博物馆中有意无意地聊着看着小智他们则是去看名为金刚玉魂的传说中的秘宝孤叶没有多大兴趣让小智他们自己去孤叶与洁儿在大厅中呆在一起。
可是突然警铃大做博物馆开始都被封锁起来而且无数警察围住了博物馆。
孤叶与洁儿找到了小智他们也认识了他们认识的一位同时挑战华丽大赛跟神奥联盟的吟游诗人——尚志先生！
还有一个酷爱草系宠物小精灵的百代道馆训练家——菜種小姐！
还出现了出来度假的常磐市君莎小姐百代的君莎小姐好像有些好强两人不对路的感觉。
菜穜还说了一些关于两只传说中的宠物小精灵——帝牙卢卡与帕路奇犽的故事！
为了寻找金刚玉魂还有尚志先生走失的向日花怪澄清尚志先生的嫌疑小智他们还有他们的宠物小精灵们行动了起来。
在寻找了一段时间后皮卡丘突然找到了大家要大家跟着走应该是找到线索了跟着皮卡丘遇上了一对奇葩的人还有喵喵！
向日花怪的一字斩（国语版翻译）撕掉了两人的伪装还是火箭队这几个家伙虽然在最后百代市的君沙小姐的臭鼬噗放出的臭味解决了问题。
但是火箭队也借着臭味跑掉了虽然金刚玉魂拿了回来但是火箭队所说的是有人托他们这么做的一阵迷雾出现在大家眼前孤叶想了想心道是新的邪恶组织吗？
是的话应该是那群家伙吧！孤叶想着前世所看的故事情节······
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------百代道馆---------------------------------------------------------------------------------------------------------------
经历了百代市博物馆事件后在次日孤叶与洁儿还有小智一行来到了百代道馆。
“百代道馆的对战场地种植了这么多的草木啊！”小光看着百代道馆里的环境吃惊道。
小刚说道：“对于草系宠物小精灵来说是个理想的空间呢！”
百代道馆的裁判兼管理员说道：“毕竟我们的道馆训练家是草系宠物小精灵的专家啊！”
“小智！”“恩？”众人转过头菜穜小姐走了过来。
菜穜小姐说道：“欢迎光临百代道馆！今天直接了当！是适合打道馆赛的好日子呢！我们彼此打一场不会后悔的对战赛吧！”
小智说道：“是！这次我一定不会输的！”“皮卡丘”
菜穜小姐看向了旁边的孤叶说道：“你也是挑战道馆的吧！你跟小智誰先挑战呢？”
孤叶说道：“我明天就行了今天就先交给小智吧！”
小智说道：“谢谢你小叶！”
菜穜小姐说道：“那好我们各就位吧！”
菜穜小姐小智与裁判就位孤叶洁儿还有小光小刚在观众席做好裁判宣布道：“那么现在挑战者小智对道馆训练家菜穜的道馆赛即将开始！可使用的宠物小精灵为三只其中一方的宠物小精灵全都失去战斗能力的时候比赛就结束！另外在比赛中只用挑战者才拥有替换宠物小精灵的权利！”
小智看向了观众席：“抱歉了皮卡丘要拜托你帮我加油啊！”“皮卡皮卡！”
小刚说道：“因为电系的皮卡丘对上草系的比较不利的关系啊！”
裁判举起双臂：“那么对战赛开始！”
菜種小姐扔出了精灵球：“去吧！直接了当！樱花宝！”
“很好！草苗龟就决定是你了！”小智也扔出了精灵球粉红色的樱桃宠物小精灵——樱花宝还有草苗龟来到了场地上。
洁儿拿出了黑色图鉴（孤叶的）图鉴音：“樱花宝樱桃宠物小精灵悬挂在叶子上的小球储存着进化所需要的养分显然的这小球肯定非常甜非常好吃。草苗龟若叶宠物小精灵背上的壳是由土形成的如果喝水时其硬度会大大的增加。”
小光说道：“首先是草苗龟对樱花宝啊！”小刚说道：“是草系宠物小精灵之间的对战诶！”“皮卡~”
菜種小姐说道：“就从你那边先开始进攻吧！”小智说道：“那好我就先进攻喽！草苗龟使用撞击！”
······
---------------------------------------------------------------------------------------------------------宠物小精灵图鉴-------------------------------------------------------------------------------------------------------------
青铜钟铜宠物小精灵钢系与超能力系宠物小精灵特性：浮游（拥有浮游特性的宠物小精灵不会受到地面属性技能攻击；沙地狱特性对浮游宠物小精灵无效；场上的撒菱与毒菱对浮游宠物小精灵无效；毒属性浮游宠物小精灵出场时不能清除毒菱；场上存在重力场状态时浮游特性无效；浮游宠物小精灵处于扎根状态时浮游特性无效；浮游宠物小精灵携带黑铁球时浮游特性无效。）/抗热（拥有抗热特性的宠物小精灵受到火属性技能攻击时攻击方技能威力减半抗热宠物小精灵受到烧伤伤害时损失hp减半）隐藏特性：重金属（拥有重金属特性的宠物小精灵自身体重翻倍）身高：13m体重：187kg一则新闻说它是沉睡了2000年之后才被人们发现。